Хорошая филогенетическая программа - Mesquite - запустил, и она тебе полчаса обсчитывает тысячу эволюционных деревьев. А все эти новомодные MEGA, PAUP и прочее - нажал на кнопочку, и вот тебе дерево за микросекунду посчиталось. Ну не вызывает оно у меня доверия, ребят.